在克利夫兰诊所公布的“2017十大医疗科技创新”中，“利用微生物组来预防、诊断和治疗疾病”排在首位[1]。这似乎也没什么意外的，无论是专业人士还是吃瓜群众，近年来都在各种各样的研究中看到了微生物的“实力”。

微生物组中目前最受关注，也最“火热”的当属肠道微生物，想要通过它来治疗疾病的话，大家也肯定能瞬间想到讨论度很高的“粪菌移植”，而为了能让患者获得更好的治疗体验，心思活络的产业界新秀Seres Therapeutics公司也瞅准时机，开发了治疗艰难梭菌感染（CDI）的粪菌胶囊SER-109。

在经历了I期临床治愈率高达97%（30名患者有29名治愈），获得FDA“突破性治疗”称号等等辉煌后，这个被产业界寄予厚望的药物却在2016年的II期临床中“折戟”，它的治疗效果与安慰剂相比并没有显著差异。结果一经公布，Seres一夜之间股票跳楼式下跌近70%，15亿美元的市值蒸发掉了2/3。

奇点糕也在想，Seres为什么会失败呢？是不是药物的成分有问题？SER-109的核心是肠道细菌，研发人员采用的是可能对CDI患者“柔弱的免疫系统”有益的50种健康人粪便中的细菌孢子。注意，是“可能有益”，这说明，研发人员对这些细菌究竟能起怎样的作用并不能做到“心中有数”，那么这是不是意味着，如果找到了确切地能够调节免疫系统的微生物，就可以很大程度上避免这种“模棱两可”，进行“精准肠道微生物移植”呢？

上周五，华盛顿大学医学院的Marco Colonna教授带领他的团队在《科学》杂志上发表文章，他们真的找到了可以调节特殊免疫细胞的肠道微生物——罗伊氏乳杆菌（Lactobacillus reuteri）！不仅如此，他们还发现，这个大量存在于健康人肠道中的有益菌想要发挥作用，还需要色氨酸的帮助[2]。Colonna教授表示，这会对许多肠道炎症疾病，例如炎症性肠病（IBD）有着很大帮助。
 

IBD以前一直被认为是个“西方病”，在经济欠发达的地区不太常见，然而近20年来，亚洲地区，尤其是我国的发病率快速上升。在这20年间，与前10年相比，近10年IBD总病例数增长超过24倍。根据2015年《自然评论：胃肠病学与肝病学》杂志发表的评论文章，在未来的10年（2015-2025）中，中国的患病率最高可能达到0.1%，2025年的患病人数将超过150万，几乎追平西方国家[3]。

作为一种慢性病，IBD对患者的折磨可谓是“全方位多角度”，反复的腹痛、腹泻、便血，不仅影响正常的工作生活，也影响情绪，所以IBD患者往往也伴随不同程度的抑郁。

过去的研究发现，IBD患者的肠道炎症是由于免疫系统过度活跃引起的[4]，而在我们的肠道中有一类特殊的免疫细胞“双阳性上皮内T细胞（double-positive intraepithelial T lymphocytes，DPIELs）”，由CD4+T细胞分化而来，负责调节免疫稳态，增加免疫系统的耐受性，“平息”过于活跃的免疫反应，可以减轻患者的炎症。
 

对于无菌小鼠来说，DPIELs是不存在的，因此这就暗示我们，肠道微生物对于它的产生是必需的。但是这个神秘的微生物是谁？和它有关的代谢产物又有什么？这些都不得而知。这次，研究人员们有了一个确切的答案。

这个研究成果的发现也可以算是源于一个“意外”，研究人员发现他们实验室中两组小鼠中的一组携带有大量的DPIELs，而另一组则少得可怜。为了探究原因，他们将携带DPIELs小鼠的菌群移植给了另外一组小鼠，结果这些小鼠也拥有了相当数量的DPIELs！而再用四种抗生素处理小鼠，DPIELs又不复存在了。

为了鉴定出确切的菌种，研究人员将四种抗生素分开使用，发现真正与DPIELs存在与否有关的是对新霉素有抗性的革兰氏阳性菌，缩小了范围后再次筛选，最终圈定了六种细菌，一个是罗伊氏乳杆菌，另外五个都是拟杆菌目细菌。经过逐一的移植，研究人员发现，只有罗伊氏乳杆菌是决定了CD4+T细胞能否分化为DPIELs，而其他几种细菌则只有增强作用。